La République d'Ouzbékistan est partagée entre une plaine désertique (désert du KyzylKum, un des plus grand du monde) , des bassins et des oasis et dominée à l'est par les montagnes du Tian Shan et du Pamir dont les sommets dépassent les 4000 mètres.
L'Ouzbékistan possède des frontières communes avec le Turkménistan, le Tadjikistan, l'Afghanistan et son principal voisin le Kazakhstan.
L'Amou-Daria et le Syr-Daria sont les deux grands fleuves de l'Ouzbékistan et se jettent dans la Mer d'Aral. Mais la culture intensive du coton irrigué par de nombreux canaux a fortement réduit l'apport en eau et a engendré un véritable désastre écologique.